Eduardo Paniagua (Madrid, 1952) es un músico especializado en la música de la España medieval.
Entre 1966 y 1983 participa en el grupo Atrium Musicae tocando instrumentos de viento y percusión. Posteriormente es miembro fundador de los grupos Cálamus y Hoquetus, especializados en la música arábigo-andaluza.
En 1994 crea los grupos Música Antigua e Ibn Baya, este último junto con el laudista Omar Metioui, para la interpretación y grabación de las Cantigas de Santa María de Alfonso X el Sabio y música andalusí respectivamente.
En paralelo funda y dirige el sello discográfico Pneuma con el que ha editado alguna de sus grabaciones musicales.